STEREOSPESIFITAS SUBSTRAT -L-ARABINOFURANOSIDASE GH51 DARI Geobacillus thermoleovorans IT-08 TERHADAP DINDING SEL Mycobacteria

MUCH ZAENAL FANANI, 081042007 (2012) STEREOSPESIFITAS SUBSTRAT -L-ARABINOFURANOSIDASE GH51 DARI Geobacillus thermoleovorans IT-08 TERHADAP DINDING SEL Mycobacteria. Thesis thesis, UNIVERSITAS AIRLANGGA.

[img]
Preview
Text (ABSTRAK)
gdlhub-gdl-s2-2013-fananimuch-23745-7.abstr-t.pdf

Download (329kB) | Preview
[img] Text (FULL TEXT)
gdlhub-gdl-s2-2013-fananimuch-23745-21full.pdf
Restricted to Registered users only

Download (2MB) | Request a copy
Official URL: http://lib.unair.ac.id

Abstract

Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui stereospesifitas substrat -L-arabinofuranosidase GH51 dari Geobacillus thermoleovorans IT-08 terhadap dinding sel Mycobacteria. Tahapan penelitian ini secara umum terbagi menjadi 3 tahap yaitu (1) produksi AbfA rekombinan dari E. coli BL21 (DE3)/pET-abfA, (2) uji aktivitas spesifik AbfA rekombinan, (3) analisis stereospesifitas AbfA secara in silico. -L-arabinofuranosidase GH51 dari G. thermoleovorans IT-08 secara laboratorium memiliki kemampuan aktivitas hidrolase pada substrat D-Araf (H37Rv dan BFCC), akan tetapi spesifitas AbfA pada substrat L-Araf (Arabinogalaktan, pektin, arabinan dan oat spelt xylan) lebih tinggi dibandingkan aktivitas spesifik pada substrat D-Araf (H37Rv dan BFCC). Secara in silico, -L-arabinofuranosidase GH51 dari G. thermoleovorans IT-08 mampu mengkatalisis substrat D-Araf melalui interaksi sidik jari antara residu katalitik dengan ligan yaitu Glu294. Analisis secara in silico mensarankan bahwa mekanisme katalitik AbfA pada substrat D-Araf diusulkan mengikuti model mekanisme katalitik AbfA pada substrat L-Araf yaitu melalui mekanisme retaining pergantian ganda 2 tahap. Spesifitas AbfA pada substrat D-Araf lebih rendah dibandingkan dengan L-Araf karena efek halangan ruang C5 D-Araf dengan residu Trp99 dan Trp298. Hasil penelitian ini melaporkan pertama kali aktivitas katalitik AbfA GH51 pada substrat D-Araf yang berasal dari dinding sel Mycobacteria.

Item Type: Thesis (Thesis)
Additional Information: KKC KK TK 03/12 Fan s
Uncontrolled Keywords: L-arabinofuranosidase GH51, substrate stereospecificity, fingerprint interaction, steric hydrance.
Subjects: Q Science > QH Natural history > QH301 Biology
Q Science > QR Microbiology > QR1-502 Microbiology
Q Science > QR Microbiology > QR75-99.5 Bacteria
Divisions: 08. Fakultas Sains dan Teknologi > Program Studi Kimia (S2)
Creators:
CreatorsEmail
MUCH ZAENAL FANANI, 081042007UNSPECIFIED
Contributors:
ContributionNameEmail
ContributorNi Nyoman Tri Puspaningsih, Prof. Dr., Dra., M.SiUNSPECIFIED
ContributorHery Suwito, Drs., M.SiUNSPECIFIED
Depositing User: Nn Dhani Karolyn Putri
Date Deposited: 2016
Last Modified: 11 Jun 2017 18:01
URI: http://repository.unair.ac.id/id/eprint/36939
Sosial Share:

Actions (login required)

View Item View Item