Innah Wulandari, - and Jola Rahmahani, - and Indah Rahmawati, - and Nurvita Putih, - and Aisyah Azahro and Kusnoto, - and Rahayu Ernawati,, - and Fedik Abdul Rantam, - (2021) Karakterisasi Molekuler Protein Hemagglutinin-Neuraminidase Virus Newcastle Disease (ND) di Surabaya Tahun 2003 dan 2016. Jurnal Medik Veteriner, 4 (2). pp. 231-242. ISSN 2615-7497 (Print), 2551-012X (Electronic)

	Text (Jurnal) Bukti Karakterisasi Molekuler Protein Hemagglutinin-Neuraminidase Virus Newcastle Disease (ND) di Surabaya Tahun 2003 dan 2016.pdf Download (1MB)
	Text (Peer Review) Validasi Karakterisasi Molekuler Protein Hemagglutinin-Neuraminidase Virus Newcastle Disease (ND) di Surabaya Tahun 2003 dan 2016.pdf Download (2MB)
	Text (Turn It In) Turnitin Karakterisasi Molekuler Protein Hemagglutinin-Neuraminidase Virus Newcastle Disease (ND) di Surabaya Tahun 2003 dan 2016.pdf Download (2MB)

Abstract

Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui perubahan asam amino, tingkat homologi nukleotida, hubungan kekerabatan, dan prediksi epitop dari gen pengkode protein HN virus Newcastle disease(ND) yang di isolasi di beberapa pasar kota Surabaya. Sampel berupa swab kloaka sejumlah 37 ekor ayam serta satu kontrol positif (LaSota). Sampel inokulasi pada TAB dan diidentifikasi melalui uji HA yang dikonfirmasi dengan uji HI. Sampel positif dilakukan PCR menggunakan primer forward dan reverse dengan target 503 bp. Hasil sekuensing kemudian dianalisis. Hasil analisis menunjukkan terdapat kesamaan asam amino antara sampel dan isolat vaksin yang berpengaruh pada dekatnya hasil persentase hasil homologi dan hubungan kekerabatan antar isolat. Epitop (NGAANNSGWGAPIHDPDYIGG) memiliki sifat imunogenik terbaik yang terdapat pada semua sampel sehingga berpeluang sebagai kandidat vaksin. Kata kunci: Newcastle Disease, protein HN, homologi, pohon filogenetik, epitop

Actions (login required)

View Item