Nabiila Nur Shadi, - (2022) IDENTIFIKASI RESIDU-RESIDU KATALITIK BETA-XILOSIDASE ASAL Thermoanaerobacterium xylanolyticum LX-11. Skripsi thesis, UNIVERSITAS AIRLANGGA.

	Text (HAL JUDUL) HAL JUDUL.pdf Download (416kB)
	Text (BAB I) BAB I.pdf Download (39kB)
	Text (FULL TEXT) FULL TEXT.pdf Restricted to Registered users only Download (7MB) | Request a copy

Abstract

Beta-D-xilosidase yang berasal dari bakteri termofil Thermoanaerobacterium xylanolytixum LX-11 (Txy-xyl) merupakan enzim xilanolitik yang berperan dalam proses degradasi xilan. Berdasarkan basis data CAZy, Txy-xyl ditemukan di dalam sub famili glikosida hidrolase 43 (GH43). Mekanisme katalitik enzim sub famili GH43 menggunakan dua residu katalitik yang berperan sebagai nukleofil dan asam-basa. Pada penelitian ini dilakukan identifikasi residu-residu katalitik Txy-xyl. Residu katalitik Txy-xyl diidentifikasi secara bioinformatika dengan cara melakukan pensejajaran residu katalitik Txy-xyl dengan Beta-D-xilosidase yang berasal dari famili GH43 lainnnya. Hasil pensejajaran menunjukkan bahwa asam amino aspartat pada urutan ke-121 dan glutamat pada urutan ke-171 diduga merupakan residu-residu katalitik Txy-xyl. Asam amino yang diduga merupakan residu katalitik dilakukan mutasi menjadi asam amino alanin sehingga dihasilkan dua mutan, yaitu D121A dann E171A. Txy-xyl wild type dan mutan diproduksi dalam sistem ekspresi E. coli BL21(DE3) dan dimurnikan menggunakan kromatografi afinitas dan kolom HisTrap. Uji aktivitas enzim Txy-xyl wild type dan mutan yang telah murni dilakukan terhadap substrat p-nitrofenil-Beta-D-xilopiranosit (pNP-X). Perbandingan hasil uji aktivitas antara Txy-xyl wild type dan mutan menunjukkan terjadinya penurunan aktivitas. Hal ini mengkonfirmasi bahwa asam amino aspartat 121 dan asam amino glutamat 171 merupakan residu-residu katalitik Txy-xyl.

Actions (login required)

View Item