AMELIA HENDRIANA WIJAYANTI, 061314453002 (2016) ANALISIS FILOGENETIK DAN PREDIKSI EPITOP IMUNOGEN GEN PENGKODE PROTEIN FUSION VIRUS NEWCASTLE DISEASE ISOLAT BLITAR PENELITIAN EKSPLORATIF LABORATORIS. Thesis thesis, UNIVERSITAS AIRLANGGA.
|
Text (HALAMAN DEPAN)
HALAMAN DEPAN .pdf Download (285kB) | Preview |
|
![[img]](https://repository.unair.ac.id/style/images/fileicons/text.png) |
Text (BAB I)
16. BAB I.pdf Restricted to Registered users only Download (106kB) | Request a copy |
|
|
Text (BAB 2)
17. BAB 2.pdf Restricted to Registered users only Download (262kB) | Request a copy |
|
|
Text (BAB 3)
18. BAB 3.pdf Restricted to Registered users only Download (97kB) | Request a copy |
|
|
Text (BAB 4)
19. BAB 4.pdf Restricted to Registered users only Download (139kB) | Request a copy |
|
|
Text (BAB 5)
20. BAB 5.pdf Restricted to Registered users only Download (212kB) | Request a copy |
|
|
Text (BAB 6)
21. BAB 6.pdf Restricted to Registered users only Download (108kB) | Request a copy |
|
|
Text (BAB 7)
22. BAB 7.pdf Restricted to Registered users only Download (87kB) | Request a copy |
|
|
Text (DAFTAR PUSTAKA)
23. Daftar Pustaka.pdf Restricted to Registered users only Download (139kB) | Request a copy |
|
|
Text (LAMPIRAN)
24. Lampiran.pdf Restricted to Registered users only Download (1MB) | Request a copy |
Abstract
Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis rangkaian nukleotida, susunan filogenetik dan prediksi epitop protein F dari virus ND isolat Blitar. Sampel organ paru, proventrikulus dan feses dikoleksi dari ayam yang terinfeksi ND di peternakan Blitar. Sampel diisolasi pada TAB dan diidentifikasi melalui uji HA yang dikonfirmasi dengan uji HI menggunakan anti serum ND. Kemudian dilakukan PCR menggunakan primer forward dan reverse dengan target 699 bp. Sekuensing dilakukan untuk mendapatkan susunan nukleotida dan dilakukan multiple aligment menggunakan GENETYX ver 10. Analisis epitop sel B protein F menggunakan program online software IEDB yang diakses dengan bebas menggunakan internet browser. Fragmen DNA virus ND yang didapatkan sebesar 699 bp. Analisis pohon filogenetik menggambarkan bahwa sampel ND Blitar masuk dalam genotipe VII, yang secara genotipe berbeda dengan isolat vaksin yang digunakan. Hal ini menunjukkan bahwa wabah penyakit ND yang terjadi di Blitar bukan disebabkan oleh virus ND yang berasal dari isolat vaksin tetapi virus lapangan genotipe VII. Hasil analisis prediksi epitop sel B protein F virus ND, masing-masing sampel dari Blitar memiliki 5-6 kandidat epitop sel B pada protein F. Hal ini dapat disimpulkan prediksi epitop sel B protein F virus ND yang didapat dari sampel Blitar dapat berpeluang sebagai kandidat imunogen yang dapat digunakan sebagai kandidat vaksin.
| Item Type: | Thesis (Thesis) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Additional Information: | KKC KK TVI.04/16 Wij a | |||||||||
| Uncontrolled Keywords: | Newcastle disease, Fusion protein, Blitar | |||||||||
| Subjects: | S Agriculture > SF Animal culture > SF600-1100 Veterinary medicine > SF780.2-780.7 Veterinary microbiology, bacteriology, virology, mycology | |||||||||
| Divisions: | 06. Fakultas Kedokteran Hewan | |||||||||
| Creators: |
|
|||||||||
| Contributors: |
|
|||||||||
| Depositing User: | Guruh Haris Raputra, S.Sos., M.M. '- | |||||||||
| Date Deposited: | 20 Apr 2016 07:47 | |||||||||
| Last Modified: | 20 Apr 2016 07:47 | |||||||||
| URI: | http://repository.unair.ac.id/id/eprint/29585 | |||||||||
| Sosial Share: | ||||||||||
Actions (login required)
 |
View Item |