MUCH ZAENAL FANANI, 081042007 (2012) STEREOSPESIFITAS SUBSTRAT -L-ARABINOFURANOSIDASE GH51 DARI Geobacillus thermoleovorans IT-08 TERHADAP DINDING SEL Mycobacteria. Thesis thesis, UNIVERSITAS AIRLANGGA.

Preview	Text (ABSTRAK) gdlhub-gdl-s2-2013-fananimuch-23745-7.abstr-t.pdf Download (329kB) | Preview
	Text (FULL TEXT) gdlhub-gdl-s2-2013-fananimuch-23745-21full.pdf Restricted to Registered users only Download (2MB) | Request a copy

Abstract

Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui stereospesifitas substrat -L-arabinofuranosidase GH51 dari Geobacillus thermoleovorans IT-08 terhadap dinding sel Mycobacteria. Tahapan penelitian ini secara umum terbagi menjadi 3 tahap yaitu (1) produksi AbfA rekombinan dari E. coli BL21 (DE3)/pET-abfA, (2) uji aktivitas spesifik AbfA rekombinan, (3) analisis stereospesifitas AbfA secara in silico. -L-arabinofuranosidase GH51 dari G. thermoleovorans IT-08 secara laboratorium memiliki kemampuan aktivitas hidrolase pada substrat D-Araf (H37Rv dan BFCC), akan tetapi spesifitas AbfA pada substrat L-Araf (Arabinogalaktan, pektin, arabinan dan oat spelt xylan) lebih tinggi dibandingkan aktivitas spesifik pada substrat D-Araf (H37Rv dan BFCC). Secara in silico, -L-arabinofuranosidase GH51 dari G. thermoleovorans IT-08 mampu mengkatalisis substrat D-Araf melalui interaksi sidik jari antara residu katalitik dengan ligan yaitu Glu294. Analisis secara in silico mensarankan bahwa mekanisme katalitik AbfA pada substrat D-Araf diusulkan mengikuti model mekanisme katalitik AbfA pada substrat L-Araf yaitu melalui mekanisme retaining pergantian ganda 2 tahap. Spesifitas AbfA pada substrat D-Araf lebih rendah dibandingkan dengan L-Araf karena efek halangan ruang C5 D-Araf dengan residu Trp99 dan Trp298. Hasil penelitian ini melaporkan pertama kali aktivitas katalitik AbfA GH51 pada substrat D-Araf yang berasal dari dinding sel Mycobacteria.

Actions (login required)

View Item