AYUDA DYAH NUREKAWATI, 091324153005 (2016) IDENTIFIKASI MYXOBOLUS SP PADA FAMILI CYPRINIDAE DENGAN METODE MOLEKULER DI PROVINSI JAWA TIMUR DAN JAWA TENGAH. Thesis thesis, Universitas Airlangga.

Preview	Text (COVER) TBPK. 05-16 Nur i COVER.pdf Download (232kB) | Preview
	Text (FULLTEXT) TBPK. 05-16 Nur i.pdf Restricted to Registered users only Download (629kB) | Request a copy

Abstract

Data morfometri yang digunakan untuk mengidentifikasi Myxobolus sp pada famili Cyprinidae yang berasal dari Jawa Timur dan Jawa Tengah menunjukkan adanya varian perbedaan bentuk dan ukuran spora, sedangkan pada jumlah coil filament belum dapat ditentukan dengan pasti. Namun apabila diamati menggunakan fase kontras dapat diperkirakan jumlah coil filament sekitar 7 – 9. Hasil penelitian menunjukkan bahwa gejala klinis yang terlihat adanya nodul pada insang yang berwarna putih atau kemerahan dan memenuhi rongga insang sehingga operculum tidak dapat menutup dengan sempurna, gerakan ikan tidak aktif, sisik geripis dan warna tubuh agak pucat/gelap. Penyakit parasit Myxobolus sp ditemukan menginfeksi famili Cyprinidae yaitu pada ikan mas, ikan koi dan ikan komet pada ukuran benih 3-10 cm. Secara morfometri ukuran Myxobolus sp yang ditemukan menginfeksi ikan komet (Carassius auratus) pada umumnya lebih panjang ± 1-2 μm, namun secara keseluruhan tidak menunjukan perbedaan yang signifikan. Primer yang digunakan untuk amplifikasi merupakan primer spesifik pada 18S rDNA untuk mendeteksi Myxobolus sp dengan menggunkan Primer ERIB1 dan ERIB10 (Barta et al.,1997). Berdasarkan hasil pemeriksaan PCR diperoleh pada proses suhu yang sama dengan beberapa tahapan annealing yang berbeda 55ºC dan 59 ºC, berdasarkan hasil elektroforesis pemeriksaan PCR (Polymerase Chain Reaction) fragmen DNA menunjukkan di 2034 bp, secara molekuler semua organ sampel yang digunakan pada penelitian ini menunjukkan positif terinfeksi Myxobolus sp, yang selanjutnya dapat dilakukan proses sekuensing. Dari hasil BLAST didapat bahwa sampel Myxobolus tersebut secara genetik mempunyai 3 kedekatan identity dengan M. ampullicapsulatus (95%), M. koi (92% dan 96%), M. Koi isolate MTR20110316 (93% dan 95%). Keseluruhan sekuen tersebut dialignment menggunakan aplikasi ClustalW pada software MEGA versi 6. Selanjutnya dari hasil alignment dapat digunakan untuk menyusun pohon filogenetik. Analisa filogenetik dilakukan dengan menggunakan Neighbor-Joining method version 3.6a2.1, tidak ada outgroup root. Hasil filogenetik diatas juga dapat mendukung hipotesa yang menyatakan bahwa spesies Myxobolus tergabung menjadi satu monofiletik yaitu kedalam famili Myxobolidae, spesies tersebut dari hasil Neighbor joining yang kemudian dibandingkan dengan literatur untuk jenis Myxobolus koi isolate MTR20110316 (Accession KJ725077.1) berasal dari Eropa dan Asia, M. Pendula berasal dari Ontario dan M. ampullicapsulatus berasal dari China. Selain itu juga banyak dari spesies yang terdaftar pada GenBank merupakan spesies Myxobolus pada famili cyprinidae. Kata kunci : Identifikasi Myxobolus sp pada famili Cyprinidae.

Actions (login required)

View Item