FITRATILLAH HILHANIF, 081411433012 (2018) STUDI FILOGEOGRAFI Calotes versiolor (DAUDIN, 1802) DI PULAU JAWA DAN MADURA. Skripsi thesis, UNIVERSITAS AIRLANGGA.
Text (ABSTRAK)
ABSTRAK.pdf Download (57kB) |
|
Text (FULLTEXT)
FULLTEXT.pdf Restricted to Registered users only until January 2022. Download (2MB) | Request a copy |
Abstract
Filogeografi merupakan ilmu yang menggabungkan filogenetik dan geografi, serta mempelajari proses distribusi geografis dari garis keturunan suatu spesies. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengelompokan Calotes versicolor dari Pulau Jawa dan Madura berdasarkan karakter morfometri, meristik dan genetic melalui DNA barcoding menggunakan gen Cytochrome Oxidase Subunit I (COI) pada DNA mitokondria. Hasil pengamatan morfologi dianalisis menggunakan analisis Cluster yang menunjukkan pengelompokan Calotes versicolor secara signifikan membentuk tiga kluster berdasarkan kisaran karakter morfometri dan menunjukkan adanya pencampuran antar daerah akibat variasi populasi. Analisis Principal Component Analysis (PCA) digunakan untuk mengetahui karakter yang berpengaruh secara signifikan dalam pembentukan kluster, karakter tersebut adalah Snout Vent Length (SVL), Head Width (HW), Axilla-groin Length (AGL), Body Diameter (BD), Tympanum Diameters (TD), Eye Diameters (ED), Tail Length (TaiL), Ventral Scales (VS), Dorsal Scales (DS), Middle Body Scales (MIDSCALE), Infra Labial Scales (ILS), dan Supra Labial Scales (SLS). Karakter genetik dianalisis menggunakan BLAST. Data hasil alignment dengan BLAST menunjukkan Calotes versicolor penelitian hanya memiliki persentase homologi dengan sekuen DNA dari database GenBank sebesar 85%. Hasil analisis morfologi juga diverifikasi dengan secara genetik dengan menggunakan analisis hubungan kekerabatan melalui MEGA7 serta analisis filogeografi melalui PopArt yang menunjukkan terbentuknya 2 haplotipe berbeda pada sekuen DNA Calotes versicolor penelitian yang memisahkan spesimen Calotes versicolor dari Jawa Barat, Jawa Tengah, serta Jawa Timur (Surabaya dan Pulau Madura) dengan spesimen Calotes versicolor dari Gresik, Jawa Timur. Terdapat ketidaksesuaian antara hasil analisis morfologi dan genetik yang menunjukkan variasi populasi secara morfologi tidak menyebabkan adanya perubahan secara genetik karena adanya aliran gen (gene flow).
Item Type: | Thesis (Skripsi) | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Additional Information: | KKC KK MPB 51/18 Hil s | |||||||||
Uncontrolled Keywords: | Filogeografi, Calotes versicolor, morfologi, genetik, DNA barcoding,gen COI, aliran gen | |||||||||
Subjects: | Q Science Q Science > QH Natural history > QH426 Genetics |
|||||||||
Divisions: | 08. Fakultas Sains dan Teknologi > Biologi | |||||||||
Creators: |
|
|||||||||
Contributors: |
|
|||||||||
Depositing User: | mat sjafi'i | |||||||||
Date Deposited: | 11 Jan 2019 08:58 | |||||||||
Last Modified: | 11 Jan 2019 08:58 | |||||||||
URI: | http://repository.unair.ac.id/id/eprint/78438 | |||||||||
Sosial Share: | ||||||||||
Actions (login required)
View Item |