Naimah Putri (2021) Karakterisasi Molekuler Virus Newcastle Disease (ND) Isolat Lokal Pada Itik Berdasarkan Gen Matrix (M) Dan Fusion (F). Disertasi thesis, UNIVERSITAS AIRLANGGA.

	Text (HALAMAN JUDUL) 1. HALAMAN JUDUL.pdf Download (361kB)
	Text (ABSTRAK) 2. ABSTRAK.pdf Download (170kB)
	Text (DAFTAR ISI) 3. DAFTAR ISI.pdf Download (159kB)
	Text (BAB 1) 4. BAB 1 PENDAHULUAN.pdf Download (167kB)
	Text (BAB 2) 5. BAB 2 TINJAUAN PUSTAKA.pdf Restricted to Repository staff only until 18 March 2024. Download (520kB) | Request a copy
	Text (BAB 3) 6. BAB 3 KERANGKA KONSEPTUAL DAN HIPOTESIS.pdf Restricted to Repository staff only until 18 March 2024. Download (152kB) | Request a copy
	Text (BAB 4) 7. BAB 4 MATERI DAN METODE.pdf Restricted to Registered users only until 18 March 2024. Download (240kB) | Request a copy
	Text (BAB 5) 8. BAB 5 HASIL PENELITIAN.pdf Restricted to Registered users only until 18 February 2024. Download (1MB) | Request a copy
	Text (BAB 6) 9. BAB 6 PEMBAHASAN.pdf Restricted to Registered users only until 18 March 2024. Download (353kB) | Request a copy
	Text (BAB 7) 10. BAB 7 KESIMPULAN DAN SARAN.pdf Restricted to Registered users only until 17 February 2024. Download (270kB) | Request a copy
	Text (DAFTAR PUSTAKA) 11. DAFTAR PUSTAKA.pdf Download (202kB)
	Text (LAMPIRAN) 12. LAMPIRAN.pdf Restricted to Registered users only until 18 March 2024. Download (3MB) | Request a copy
	Text (PERMOHONAN EMBARGO) 13. PERMOHONAN EMBARGO.pdf Restricted to Registered users only Download (52kB) | Request a copy

Abstract

Penelitian ini adalah penelitian eksploratif laboratoris yang bertujuan untuk mengetahui karakteristik molekuler virus Newcastle disease (ND) yang berasal dari itik. Dua ratus sampel yang dikumpulkan dari swab kloaka yang diambil dari beberapa wilayah di Sumatera Barat dan Jawa Timur serta satu kontrol Positif LaSota telah diinokulasikan pada TAB SAN berumur delapan hari. Aktivitas aglutinasi diuji dengan uji hemagglutinasi dan virus yang diisolasi dilakukan karakterisasi secara molekuler dengan RT-PCR yang menargetkan gen M dan F yang lengkap. Hasil penelitian menunjukkan empat sampel positif uji RT-PCR menggunakan tiga pasang primer forward dan reverse berdasarkan gen pengkode protein M sedangkan menggunakan primer gen pengkode protein F terdapat enam sampel yang positif. Hasil analisis homologi diketahui bahwa tiga isolat (NDV/Duck/TD19/19, NDV/Duck/B104/19, dan NDV/Duck/B125/19) memiliki homologi terendah dengan vaksin LaSota JF950510.1 sebesar 87% - 88%. Isolat NDV/Duck/TD19/19 memiliki homologi tertinggi (95,67%) dengan virus ND dari ayam yang berasal dari Indonesia tahun 1951. Berdasarkan nilai homologi tersebut isolat NDV/Duck/TD/19 yang diisolasi dari itik merupakan virus original dari lapangan karena memiliki nilai homologi yang rendah jika dibandingkan dengan virus vaksin dan termasuk ke dalam kelompok patotipe avirulent (lentogenik) berdasarkan susunan asam amino pada daerah cleavage site gen pengkode protein F. Hasil analisis kekerabatan menunjukkan tiga isolat (NDV/Duck/B104/19, NDV/Duck/B125/19, dan (NDV/Duck/BK43/19) melalui ranting pohon filogenetik berhubungan dekat dengan isolat yang termasuk dalam genotipe VII. Isolat NDV/Duck/TD19/19 termasuk ke dalam genotipe VI dan dua isolat lainnya (NDV/Duck/A74/19 dan NDV/Duck/B147/19) termasuk ke dalam genotipe II.

Actions (login required)

View Item