Arshita Buwana Dwiandari (2021) Analisis Homologi dan Filogenetik Gen Hexon Protein Fowl Adenovirus Penyebab Inclusion Bodies Hepatitis pada Ayam Broiler di Salatiga. Skripsi thesis, UNIVERSITAS AIRLANGGA.

	Text (HALAMAN JUDUL) 1. HALAMAN JUDUL.pdf Download (321kB)
	Text (ABSTRAK) 2. ABSTRAK.pdf Download (345kB)
	Text (DAFTAR ISI) 3. DAFTAR ISI.pdf Download (241kB)
	Text (PENDAHULUAN) 4. BAB 1 PENDAHULUAN.pdf Download (250kB)
	Text (TINJAUAN PUSTAKA) 5. BAB 2 TINJAUAN PUSTAKA.pdf Restricted to Registered users only until 10 June 2024. Download (654kB) | Request a copy
	Text (METODE PENELITIAN) 6. BAB 3 MATERI DAN METODE.pdf Restricted to Registered users only until 14 June 2024. Download (451kB) | Request a copy
	Text (HASIL PENELITIAN) 7. BAB 4 HASIL PENELITIAN.pdf Restricted to Registered users only until 14 June 2024. Download (1MB) | Request a copy
	Text (PEMBAHASAN) 8. BAB 5 PEMBAHASAN.pdf Restricted to Registered users only until 14 June 2024. Download (157kB) | Request a copy
	Text (KESIMPULAN DAN SARAN) 9. BAB 6 KESIMPULAN DAN SARAN.pdf Restricted to Registered users only until 14 June 2024. Download (112kB) | Request a copy
	Text (DAFTAR PUSTAKA) 10. DAFTAR PUSTAKA.pdf Download (369kB)
	Text (LAMPIRAN) 11. LAMPIRAN.pdf Restricted to Registered users only Download (980kB) | Request a copy
	Text (EMBARGO) 12. EMBARGO.pdf Restricted to Registered users only Download (215kB) | Request a copy

Abstract

Inclusion Bodies Hepatitis (IBH) merupakan penyakit yang menyerang ayam usia 3 minggu – 7 minggu dan disebabkan oleh Fowl Adeno Virus (FAdVs) kelompok 1. IBH menyebabkan tingkat kematian yang sangat tinggi di kalangan ayam broiler, selain itu penyakit ini juga menimbulkan kerugian ekonomi. IBH pertama kali dilaporkan ada di Indonesia pada tahun 1985 di Pulau Jawa. Meskipun pada saat ini kasus IBH sedang meredup, namun bisa dipastikan kemunculannya kembali akan mengakibatkan kerugian karena di Indonesia belum ditemukan vaksin untuk mengatasi penyakit ini. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui ada atau tidaknya FAdVs pada sampel yang diuji menggunakan Polymerase Chain Reaction serya menganalisis homologi dan filogenetik gen hexon protein pada ayam broiler yang terdeteksi terinfeksi IBH di Salatiga selanjutnya dibandingkan dengan isolat pembanding dari beberapa negara yang didapatkan dari Genbank. Sampel pada penelitian ini berjumlah 3 ekor ayam broiler yang diambil dari peternakan dengan populasi 10.000 ekor ayam di Salatiga untuk diambil organ heparnya. Sampel selanjutnya dilakukan isolasi DNA menggunakan DNA Invitrogen, setelah itu dilakukan pemeriksaan Polymerase Chain Reaction menggunakan sepasang primer forward dan reverse dengan target 897 bp. Hasil positif dari pemeriksaan PCR selanjutnya disekuensing sehingga diketahui sekuen nukleotida dilakukan analisis homologi menggunakan BLAST Needleman-Wunsch Global Align Nucleotide Sequences dari NCBI. Hasil penelitian, dari 3 sampel hanya satu yang didapatkan fragmen DNA dengan panjang 897bp dari isolat hasil amplifikasi PCR yang selanjutnya diberi nama sampel IBH/CHK/H3/SLTG/2020. Hasil homologi diketahui bahwa sampel IBH/CHK/H3/SLTG/2020 dengan isolat reference sequence MG712775.1 China/2018, MF614119.1 China/2018, MN226943.1 China/2020, dan KU981148.1 China 2017 menunjukkan homologi sebesar 97%. Hasil analisis filogenetik menunjukan bahwa sampel IBH/CHK/H3/SLTG/2020 memiliki kedekatan satu clade dengan isolat virus MG712775.1 China/2018 sebagai referense sequence, MF614119.1 China/2018, MN226943.1 China/2020, KU517714.1 Malaysia/2016, KU981148.1 China/2017, NC_038332.1 Jepang/2020, MK572863.1 dan berbeda clade dengan isolat virus Jerman/2019, MK572860.1 Jerman/2019

Actions (login required)

View Item