SNR. ANIEKA ROCHMAH, 068410914 (2013) ANALISIS ANTIGENIC SITE DAN PHYLOGENIC GEN HAEMAGLUTININ VIRUS AI SUBTIPE H5N1 DARI ISOLAT AYAM KAMPUNG DI BEBERAPA DAERAH DI INDONESIA SEBAGAI KANDIDAT SEED VAKSIN. Thesis thesis, Universitas Airlangga.

Text SNR. Anieka Rochmah.pdf Download (5MB)

Abstract

Flu burung atau Avian Influenza (AI) merupakan penyakit yang bersifat zoonosis terjadi pada unggas dan manusia. Penyakit flu burung disebabkan oleh virus Avian Influenza (AI) tipe A dari famili Orthomyxoviridae. Virus AI dibedakan menjadi Highly Pathogenic Avian Influenza (RPAI) dan Low Pathogenic Avian Influenza (LPAI). Di antara subtipe virus influenza A, subtipe H5, H7 dan H9 telah diketahui mempunyai patogenitas yang tinggi. Kematian pada unggas menimbulkan dampak sosiaI ekonomi yang sangat serius meliputi: (a) keterpurukan pada industri perunggasan; (b) meningkatnya impor produk petemakan; (c) kepanikan masyarakat yang berakibat pada konsumsi telur dan daging ayam menurun. Virus ini telah mengalami diversifikasi baik genetik maupun antigenik sehingga berpengaruh pada kebutuhan virus sebagai kandidat seed vaksin untuk persiapan apabila terjadi pandemi (WHO, 2012). Virus AI yang ditemukan tahun 2008-2010 diduga telah berubah secara genetik dan antigenik berbeda dengan virus AI yang ditemukan saat terjadi kasus AI tahun 2003-2007. Virus ini dikhawatirkan lebih berbahaya dibandingkan dengan sebelumnya, perubahan tersebut tidak lepas dari karakter dasar virus AI yang mudah bermutasi. Tidak semua vaksin yang terdaftar secara resmi memberikan perlindungan yang memadai dan oleh karena itu seed vaksin secara antigenik dan genetik harus sesuai dengan virus lapang. Pengkaj ian terhadap vaksin AI hams secara terus menerus dilakukan untuk memastikan apakah vaksin masih memberikan perlindungan secara sempurna. Penelitian ini bertujuan untuk mengkarakterisasi secara molekuler gen pengkode HA dan daerah antigeniklantigenic site virus AI isolat ayam kampung yang diambil dari beberapa daerah di Indonesia yang akan digunakan sebagai kandidat seed vaksin, dengan cara menganalisis heterogenitas asam amino pada gen HA virus AI subtipe H5N1, menentukan kandidat seed vaksin berdasarkan daerah antigeniklantigenic site, dan menganalisis hubungan kekerabatanlphylogenic virus AI antar isolat ayam kampung dari beberapa daerah di Indonesia dibandingkan dengan virus AI lain di Indonesia yang berada di bank gen.

Actions (login required)

View Item