ENDANG SUPRIHATI, 090970104D (2013) ANALISIS FILOGENETIKA GEN CYTOCHROM B Leucocytozoon spp. PADA AYAM RAS DI WILAYAH ENDEMIS INDONESIA. Disertasi thesis, UNIVERSITAS AIRLANGGA.

Preview	Text (ABSTRAK) gdlhub-gdl-s3-2015-suprihatie-34831-6.abstr-k.pdf Download (254kB) | Preview
Preview	Text (ABSTRAK 2) gdlhub-gdl-s3-2015-suprihatie-34831-7.abstr-t.pdf Download (252kB) | Preview
	Text (FULLTEXT) Binder1suprihatie.pdf Restricted to Registered users only Download (1MB) | Request a copy

Abstract

Latar belakang dan tujuan: Selama ini deteksi terhadap Leucocytozoon didasarkan pada analisis morfologi parasit menggunakan mikroskop terhadap hapusan ulas darah yang kadang-kadang gagal menemukan parasit pada kasus parasitemia yang rendah, apalagi stadium gamet dari parasit ini hanya satu minggu berada di sirkulasi darah. Oleh karena itu perlu dikembangkan metode diagnosis secara molekuler antara lain dengan metode Polymerase Chain Reaction (PCR), metode ini belum dikembangkan di Indonesia untuk deteksi Leucocytozoonosis. Identifikasi morfologi Leucocytozoon spp., seringkali tidak bisa ditetapkan sampai penentuan spesies karena ada variasi morfologi sehingga kesulitan dalam mengkarakterisasi morfologi parasit. Penelitian menggunakan biologi molekuler akan diketahui sampai species bahkan bisa menunjukkan keragaman genetik leucocytozoon diantara species. Oleh karena itu melalui penelitian ini ingin diketahui apakah variasi morfologi Leucocytozoon yang menyerang ayam ras juga terjadi variasi genetiknya. Bagaimana homologi susunan nukleotida diantara isolat Leucocytozoon yang menyerang ayam ras di berbagai daerah endemis dibandingkan dengan Leucocytozoon yang ada di Gene Bank, dan bagaimana filogenetiknya. Tujuan dari penelitian ini adalah: 1) Menganalisis variasi morfologi Leucocytozoon yang menyerang ayam ras di wilayah endemis Indonesia; 2) Identifikasi Leucocytozoon dengan penggunaan PCR pada mtDNA gen cyt b Leucocytozoon yang menyerang ayam ras di wilayah endemis Indonesia; 3) Penentuan spesies dan galur Leucocytozoon dengan metode BLAST; 4) Mengetahui homologi antar takson Leucocytozoon dari berbagai wilayah endemis Indonesia; 5) Mempelajari filogenetik Leucocytozoon pada ayam ras di wilayah endemis Indonesia. Materi dan Metode: Pada penelitian ini dibagi dalam lima tahap: 1) koleksi data kejadian kasus leucocytozoonosis di daerah endemis Indonesia, 2) identifikasi parasit Leucocytozoon secara morfologis melalui pemeriksaan mikroskopis, 3) identifikasi gen cyt b Leucocytozoon yang menyerang ayam ras di daerah endemis dengan metode PCR dan Sekuensing, 4) identifikasi urutan nukleotida yang menentukan spesies menggunakan perangkat lunak BLAST. 5) analisis filogenetik Leucocytozoon yang menyerang ayam di daerah endemis dengan perangkat lunak Mega 5. Hasil dan kesimpulan: Hasil penelitian ini menunjukkan 1) Terdapat variasi morfologi Leucocytozoon yang menyerang ayam ras di wilayah endemis Indonesia; 2) Hasil identifikasi L._caulleryi dengan PCR menunjukkan panjang basa 600 bp pada putaran ke 1 dan 503 bp pada putaran ke-2; 3) Hanya L.caulleryi yang ditemukan pada ayam ras di wilayah endemis Indonesia; 4) Homologi antar takson L caulleryi dari berbagai wilayah endemis sangat tinggi; 5) L. caulleryi dari masing-masing wilayah mempunyai kekerabatan yang sangat erat satu dengan yang lainnya. Penelitian juga menunjukkan ditemukannya Plasmodium juxtanucleare dari hasil pemeriksaan metode BLAST yang ditemukan di Blitar dan Lumajang, yang morfologi dan profil PCR mirip L.caulleryi.

Actions (login required)

View Item