Syahriar Nur Maulana Malik Ibrahim, 081511433053 (2018) Identifikasi Bakteri Selulolitik dari Taman Nasional Alas Purwo Melalui Pendekatan Biokimia, Proteomik, dan Molekular. Skripsi thesis, Universitas Airlangga.

	Text (Abstrak) MPB. 05-19 Ibr i Abstrak.pdf Download (94kB)
	Text (Fulltext) MPB. 05-19 Ibr i.pdf Restricted to Registered users only until 19 February 2022. Download (1MB) | Request a copy

Abstract

Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi bakteri selulolitik dari Taman Nasional Alas Purwo melalui pendekatan biokimia, proteomik, dan molekular. Tiga bakteri selulolitik koleksi laboratorium yang diisolasi dari vegetasi Hutan Bambu Pancur dan Hutan Bambu Sadengan, Taman Nasional Alas Purwo dengan kode BPA-A, BPA-B, dan BSA-D. Pendekatan biokimia menggunakan uji biokimia pada media NaCl 5%, uji oksidase, uji katalase, uji motilitas, pewarnaan Gram, pewarnaan endospora, dan kit Microbact 12A dan 12B. Pendekatan proteomik menggunakan MALDI-TOF MS. Pendekatan molekular dengan mengisolasi genom isolat menggunakan metode CTAB lalu genom diamplifikasi bagian sekuens gen 16S rRNA dan disekuensing. Hasil identifikasi dengan uji biokimia, isolat BPA-A memiliki kesamaan 58% dengan Bacillus cereus, BPA-B memiliki kesamaan 52% dengan Bacillus subtilis, dan BSA-D memiliki kesamaan 60% dengan Staphylococcus arlettae. Identifikasi proteomik, hanya isolat BPA-A yang teridentifikasi sebagai B. cereus dengan kesamaan peak protein 99.9% sedangkan isolat BPA-B dan BSA-D tidak teridentifikasi. Identifikasi molekular, ketiga isolat teridentifikasi masing-masing isolat BPA-A, BPA-B, dan BSA-D sebagai B. cereus strain DFT-6, B. subtilis strain BA14, dan S. arlettae strain SGI-2 dengan rentang identik 93—96% dan querry cover 76—100%. Kesimpulan dari penelitian ini, yaitu hasil identifikasi biokimia isolat BPA-A memiliki kesamaan 58% dengan B. cereus, BPA-B memiliki kesamaan 52% dengan B. subtilis, dan BSA-D memiliki kesamaan 60% dengan S. arlettae., hasil identifikasi proteomik isolat BPA-A teridentifikasi dengan B. cereus dengan 99.9% kesamaan peak protein sedangkan isolat BPA-B dan BSA-D tidak teridentifikasi, dan hasil identifikasi molekular isolat BPA-A terdentifikasi sebagai B. cereus strain DFT-6 dengan identik 96% dan querry cover 100%, isolat BPA-B teridentifikasi sebagai B. subtilis strain BA14 dengan identik 93% dan querry cover 84%, dan isolat BSA-D teridentifikasi sebagai S. arlettae strain SGI-2 dengan identik 96% dan querry cover 76%.

Actions (login required)

View Item